最も単純な実行方法のみ説明します。全てのコマンドライン・パラメータを知りたい場合は GraphViz の公式サイトを参照してください。
dot -Tpng input.dot
dot -Tsvg input.dot
GraphViz が出力可能な画像フォーマットは公式サイトの出力フォーマットセクションにリストされていますので参照してください。画像フォーマットによっては追加のライブラリのインストールが必要になる場合もあります。